V jádře lipoproteinu jsou hydrofobní triacylglyceroly (TAG) a estery cholesterolu, obal je tvořen z fosfolipidů a volného neesterifikovaného cholesterolu, které jsou více polárnější. Každý lipoprotein má na povrchu alespoň jeden apoprotein, což je hlavní bílkovinná část lipoproteinu sloužící k jeho syntéze, dále také se apoproteiny vážou na specifické receptory na povrchu buněk a tím dostanou lipoproteiny z krevního oběhu do buněk.