Vypracované státnicové otázky - Laboratorní technika v genomice a proteomice
Popis:
1. Vícerozměrné signály - analogová reprezentace obrazů, 2D spektra, vzorkování obrazů
2D analogový signál
- funkce dvou spojitých proměnných f(x,y)
- funkce obvykle interpretována jako jas (nebo stupeň šedi) obrazu určen souřadnicemi x a y v prostoru, které určují polohový vektor r = (x,y)
- velikost obrazu v praxi vždy limitována (obvykle obdélník s počátkem souřadnic v jeho středu)
- většinou šedotónové obrazy (ještě může být povrchová reprezentace) - výstup téměř všech zdravotnických zobrazovacích systémů
- další barvy se používají většinou jen pro značení; reprezentace barevného obrazu vektorovou funkcí:
Komponenty popisují jas jednotlivých barev (např. RGB), nebo může být použita trojice komponent (např. jas, barevný odstín a sytost)
- speciální případ signálu s vektorovými hodnotami - obraz s komplexními hodnotami (reálná a imaginární složka) - teoretický význam
vícerozměrný signál - zobecnění 2D konceptu
- f(x), x může být skalár (čas v 1D signálu), ale většinou má 2-4 komponenty
- 3D vektor reprezentuje
o 3 prostorové souřadnice (tomografické zobrazovací systémy)
o 2 prostorové souřadnice a čas (pohyb, animace)
- 4D případ - 3D data proměnná v čase
Klíčová slova:
vícerozměrné signály
vzorkovací frekvence
skenovací technika
chromatografie
genetické algoritmy
optimalizace
rovinná grafika
Obsah:
- 1. Vícerozměrné signály - analogová reprezentace obrazů, 2D spektra, vzorkování obrazů
2. Číslicová reprezentace a diskrétní spektra obrazů, diskrétní 2D operátory, zvýrazňování obrazů
3. Tomografické projekce, rekonstrukce obrazů z paralelních projekcí (algebraické a frekvenční metody, filtrovaná zpětná projekce), rekonstrukce z vějířových projekcí (rebinning)
4. Parametrické mapy, texturní analýza, metody segmentace obrazů, fúze obrazů (přednášky FABO - 6,7,8,9)
5. Konverze vzorkovací frekvence ve frekvenční a časové oblasti:
6. Vlnkové transformace s diskrétním časem, jejich využití pro filtraci a kompresi dat
7. Nelineární filtry - mediánové filtry, demultiplikace, dekonvoluce
8. Principy neparametrických a parametrických metod pro odhad výkonového spektra signálu
9. Princip světelného mikroskopu, jeho základní vlastnosti a parametry, modifikace mikroskopů pro světlé pole - vzpřímený, inverzní, stereomikroskop
10. Princip mikroskopických metod zvyšujících kontrast - temné pole, fázový kontrast, polarizační mikroskopie, metody interferenčního kontrastu
11. Princip popisu optických systémů pomocí maticového zápisu. Chování světla na rozhraní dvou optických prostředí
12. Skenovací techniky v optické mikroskopii - komponenty mikroskopu, jedno a dvou fotonová konfokální mikroskopie, koherentní tomografie
13. Technické prostředky zabezpečující práci s biologickým materiálem (požadavky na zabezpečení laboratoří a konkrétní řešení, digestoře, laminární boxy, izolátory, inkubátory aj.)
14. Práce s DNA - PCR, PCR pracující v reálném čase, sekvenátory DNA, elektroforéza
15. Chromatografie (základní princip, konstrukce přístroje, plynová a kapalinová chromatografie)
16. Spektrometrické přístroje (typy spektrometrických přístrojů, základní principy měření, konstrukce přístrojů), vlastnosti a použití fluorescenčních barviv
17. Stochastické algoritmy pro hledání globálních extrémů (náhodné prohledávání, simplexová metoda, řízené náhodné prohledávání s populací, evoluční prohledávání se dvěma populacemi)
18. Genetické algoritmy, evoluční operátory, vliv evolučních operátorů na přežití schématu v generaci
19. Experimentální ověřování a porovnávání stochastických algoritmů pro optimalizaci, podmínky ukončení algoritmů
20. Optimalizace s jednorozměrnou a vícerozměrnou účelovou funkcí, gradient, Hessova matice, numerický výpočet derivací
21. Obraz a jeho reprezentace - světlo a barvy v počítačové grafice, digitalizace, komprese rastrového obrazu, rastrové formáty
22. Rovinná grafika - dvourozměrné objekty, rasterizace, vyplňování útvarů, transformace barev, geometrické transformace diskrétního obrazu
23. Trojrozměrné modely - křivky a plochy, Bézierovy křivky a plochy, reprezentace a modelování těles, objemová reprezentace těles
24. Zobrazování prostorových dat - promítání, světlo a odraz světla, Phongův osvětlovací model, řešení viditelnosti, stíny, textury
O souborech cookie na této stránce
Soubory cookie používáme pro funkční účely, pro shromažďování a analýzu informací o výkonu a používání stránky.