Mikrobiologie (pro zahradnické obory) - obecná část a ekologie mikroorganismů

mikrobiologie

mikroorganismy

metabolismus

genetika

koloběh živin

• 1 Úvod, aneb proč studovat mikrobiologii -5-
  2 Definice vědního oboru mikrobiologie a jeho stručná historie -7-
  3 Chemické složení mikrorganismů a jejich výživa -10-
  3.1 Prvkové složení mikroorganismů -10-
  3.2 Látkové složení mikroorganismů -12-
  3.3 Charakteristika organismů podle typu výživy -15-
  3.3.1 Klasifikace organismů podle zdroje uhlíku -15-
  3.3.2 Klasifikace organismů podle donorů elektronů -16-
  3.3.3 Klasifikace organismů podle způsobu získávání energie -16-
  3.3.4 Klasifikace organismů podle nároků na vzdušný kyslík -19-
  3.4 Příjem živin a exkrece látek mikrobiální buňkou -19-
  4 Metabolismus mikroorganismů -21-
  4.1 Všeobecná charakteristika metabolismu -21-
  4.2 Odlišnosti metabolismu mikroorganismů a vyšších organismů -22-
  4.3 Enzymy -22-
  4.4 Biologická tvorba a přenos energie -25-
  4.5 Rozklad látek mikroorganismy -27-
  4.5.1 Katabolismus chemoheterotrofních mikroorganismů -28-
  4.5.2 Katabolismus chemoautotrofních mikroorganismů -51-
  4.6 Anabolismus mikroorganismů -55-
  4.6.1 Biosyntéza monosacharidů -55-
  4.6.2 Biosyntéza aminokyselin a proteosyntéza -56-
  4.6.3 Asimilace anorganického dusíku - fixace vzdušného dusíku -56-
  5 Genetika mikroorganismů -57-
  5.1 Co zkoumá genetika mikroorganismů -57-
  5.2 Genetika prokaryotních mikroorganismů -58-
  5.2.1 Chromosom prokaryot -58-
  5.2.2 Značení bakteriálního genotypu -59-
  5.2.3 Replikace -59-
  5.2.4 Struktura genomu -60-
  5.2.5 Plasticita prokaryotického genomu -60-
  5.3 Genetika eukaryotních mikroorganismů -64-
  5.3.1 Chromosom eukaryot -64-
  5.3.2 Proměnlivost eukaryotického genomu -65-
  5.3.3 Genetika kvasinek -65-
  5.3.4 Parasexuální cyklus mikroskopických hub -67-
  6 Zařazení mikroorganismů v systému organismů -68-
  6.1 Mikroorganismy bez buněčné struktury -70-
  6.1.1 Viry -70-
  6.1.2 Priony -79-
  6.2 Mikroorganismy s prokaryotickou buňkou -81-
  6.2.1 Stavba prokaryotické buňky -81-
  6.2.2 Doména archaea -91-
  6.2.3 Doména bacteria -94-
  6.3 Mikroorganismy s eukaryotickou buňkou -107-
  6.3.1 Stavba eukaryotické buňky -107-
  6.3.2 Říše fungi (houby) -113-
  6.3.3 Říše chromista -128-
  6.3.4 Říše protozoa (prvoci) -129-
  6.3.5 Říše plantae (rostliny) -133-
  Použitá a doporučená literatura -136-
  
  1 Ekologie mikroorganismů -4-
  1.1 Vztahy organismů v ekosystému s důrazem na mikroorganismy -5-
  1.1.1 Mikrobiální biofilm -14-
  1.2 Vztahy mezi mikroorganismy a rostlinami -20-
  1.2.1 Mykorhiza -22-
  1.3 Vztahy mezi mikroorganismy a živočichy -28-
  1.3.1 Manipulační aktivita -31-
  2 Růst mikroorganismů -32-
  2.1 Významné faktory prostředí působící na růst mikroorganismů -35-
  2.1.1 Fyzikální faktory působící na mikroorganismy -37-
  2.1.2 Chemické faktory působící na mikroorganismy -43-
  3 Mikrobiologie vzduchu, vody a půdy -48-
  3.1 Mikroorganismy a vzduch -48-
  3.2 Mikroorganismy a voda -50-
  3.3 Mikroorganismy a půda -54-
  3.3.1 Rozdělení půdních organismů -57-
  3.3.2 Prostorové rozmístění a počty organismů v půdě -60-
  3.3.3 Dekompoziční procesy -63-
  3.3.4 Bioremediace -69-
  4 Koloběhy živin a úloha mikroorganismů v nich -69-
  4.1 Koloběh uhlíku -70-
  4.1.1 Uhlík v půdě -72-
  4.1.2 Vliv antropogenní činnosti na obsah půdní organické hmoty a globální koloběh uhlíku -76-
  4.2 Koloběh dusíku -78-
  4.2.1 Biologická fixace molekulárního dusíku -79-
  4.2.2 Mineralizace organických dusíkatých látek -84-
  4.2.3 Imobilizace minerálního dusíku -90-
  4.2.4 Denitrifikace -91-
  4.3 Koloběh fosforu -93-
  4.4 Koloběh síry -95-
  4.4.1 Asimilace a imobilizace síry -96-
  4.4.2 Mineralizace síry -97-
  Použitá a doporučená literatura -100-